Koordinat umum desa Desa Mojowarno sekitar 112°17′–112°18′ BT dan 7°38′ LS, dengan elevasi berkisar ±60 m di atas permukaan laut. 

Wilayah Desa Mojowarno berada di  jalur Pantura, berbatasan dengan wilayah Kabupaten Pati. dan termasuk dalam wilayah dataran rendah.

Batas Wilayah sebagai berikut:

• Utara      : berbatasan dengan Laut Jawa
• Timur      : berbatasan dengan Desa Dresi Kulon
• Selatan   : berbatasan dengan Desa Dresi Kulon, Dukuh RUmbut Malang 
• Barat       : berbatasan dengan Desa Tambak Agung

• Jarak ke Ibu Kota Kecamatan                         : 2  Km
• dengan kendaraan bermotor lama tempuh     : 10 menit
• Jarak ke Ibu Kota Kabupaten                          : 12 Km
• dengan kendaraan bermotor lama tempuh     : 30 menit

Luas wilayah Desa Mojowarno seluas 346,225   Ha.